Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930544D05RikJ3QK56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930544D05RikJ3QK56 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms