Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AK157302I3ITR1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms