Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pot1bH7BX60 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms