Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r67G5E8C1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms