Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms