Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnmal2G3X9N3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnmal2G3X9N3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnmal2G3X9N3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms