Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hmgxb3G3X9M3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms