Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmigd3G3X8R9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmigd3G3X8R9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms