Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ScaperF8VQ70 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScaperF8VQ70 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms