Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9yF8VPU6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9yF8VPU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9yF8VPU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms