Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h7bF8VPP8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h7bF8VPP8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms