Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pcdh9F8VPK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh9F8VPK8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh9F8VPK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh9F8VPK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh9F8VPK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms