Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3443F7CCV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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