Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28048F7BCN0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms