Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8005F6YKY3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms