Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8247F6VRJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms