Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933403O08RikF6UK53 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms