Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngap1F6SEU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms