Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc7bE9Q9Y3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc7bE9Q9Y3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1763.6 ms