Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Aknad1E9Q8N6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aknad1E9Q8N6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aknad1E9Q8N6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms