Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Urb2E9Q7L1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Urb2E9Q7L1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Urb2E9Q7L1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms