Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp31E9Q6Y8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms