Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms