Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85cE9Q6B2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms