Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BC005561E9Q5E2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
BC005561E9Q5E2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BC005561E9Q5E2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BC005561E9Q5E2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms