Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20518E9Q548 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms