Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms