Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt90E9Q1Z0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms