Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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