Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3893E9Q1I1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3893E9Q1I1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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