Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo5cE9Q1F5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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