Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms