Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fndc1E9Q043 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fndc1E9Q043 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fndc1E9Q043 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms