Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sfta2E9PXB6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms