Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifit3bE9PV48 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifit3bE9PV48 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifit3bE9PV48 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ifit3bE9PV48 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ifit3bE9PV48 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifit3bE9PV48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms