Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930558K02RikE0CXC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms