Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm21560D3Z7A4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21560D3Z7A4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms