Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r49D3Z6L3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r49D3Z6L3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms