Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms