Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms