Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms