Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
3425401B19RikD3Z1D3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
3425401B19RikD3Z1D3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
3425401B19RikD3Z1D3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms