Protein–RNA interactions for Protein: D3YYM4

Wdr72, WD repeat-containing protein 72, mousemouse

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr72D3YYM4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr72D3YYM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr72D3YYM4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms