Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SafbD3YXK2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms