Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo5D3YW29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rexo5D3YW29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms