Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17333C6EQI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17333C6EQI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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