Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms