Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd34aB2RW11 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd34aB2RW11 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms