Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clrn2B2RVW2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms