Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rd3lB2RV38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms